自动门常见的安全保护装置有安全光幕和对射电眼；两者之间在功能和应用上存在一些区别，具体体现在以下几个方面：

1. 工作原理：安全光幕主要基于光电传感技术，由多个光电发射器和接收器组成，形成一个光屏障。当物体进入该光屏障范围时，光线被遮挡或反射，从而触发警报信号。而对射电眼则通过发射器和接收器之间的红外线或激光束进行工作，当光束被物体阻断时，接收器无法接收到信号，从而触发相应的反应。

2. 安全性能：安全光幕在安全性能方面较高，它采用多条光束或交叉光束进行检测，能够检测更小的物体，盲区更小。而对射电眼虽然也能提供一定程度的安全保护，但其检测范围和安全性能相对较低。

3. 应用领域：由于安全光幕的高安全性能，它通常被用于自动门、电梯等要求高安全。安全光幕在安装时只需进行简单的对其和连接，而对射电眼需要精准的对其，因此在安装和保养方面，对射电眼需要耗费的精力会更多一些。 

综上所述，自动门的安全光幕和对射电眼在工作原理、安全性能和应用领域方面存在明显的区别。在选择使用哪种设备时，需要根据具体的应用场景和需求来进行评估。